לכלוך נוטה להצטבר על הקיר הפנימי של צינור ניקוי הניקוז. בהשוואה לצינורות ניקוז קשיחים וחלקים מסוג PVC וצינורות נירוסטה, צינורות ניקוי גמישים מפתחים עיבוי מהר יותר וצוברים יותר מזהמים. ללא ניקוי קבוע, שכבות לכלוך מתמשכות ייווצרו לחסום צינורות ולייצר ריחות לא נעימים. מאפייני החומר, איכות מי הניקוז והרגלי המשתמש מביאים יחד לתופעה זו.
מנקודת המבט של מבנה החומר, הקיר הפנימי של צינור ניקוי ניקוז רגיל אינו חלק במראה. בורות זעירים בלתי נראים, נקבוביות ומרקמים נשארים לאחר יציקת גומי-פלסטיק. מיקרו חלקיקים של משקעים, אבק ואבנית במים זורמים נטמעים בנקבוביות הקיר הללו ויוצרים שכבות לכלוך ראשוניות. עבור צינורות קשיחים, משטחים פנימיים קומפקטיים וחלקים עוצרים את הדבקות המזהמים, ומים רגילים שוטפים שאריות ללא מאמץ. חוץ מזה, כיפוף וקיפול תכופים במהלך השימוש בצינור יוצרים מיקרו קמטים על קירות הצינור. קמטים אלה לוכדים בקלות פסולת והופכים לאזורי מפתח להשקעת לכלוך.
איכות המים בתרחישים שונים של יישומים מביאה לפערים עצומים בחומרת הזיהום. ניקוז ביתי מכיור וניקוז רצפה מכיל פסולת עור, שיער ואבק. שפכי מטבח נושאים שומן ושאריות מזון. שפכים ממכונת כביסה מכילים שאריות של חומרי כביסה וסיבי בד. מזהמים דביקים כאלה נדבקים לשכבות הלכלוך הראשוניות על קירות הצינור כאשר המים זורמים דרכם. שכבה אחר שכבה יוצרת בוץ שמן צהבהב או חום כהה עקשני ואבנית בוץ לאורך זמן. לכלוך שנעוגה מקטין את הקוטר הפנימי של הצינור בצורה מדהימה ומוריד את יעילות הניקוז.
הרגלי שימוש רעים מאיצים את הידבקות הלכלוך והידרדרות. משתמשים רבים מאחסנים צינורות ישירות לאחר השימוש מבלי לשטוף או לרוקן שאריות מים. שפכים עומדים מתיישבים בתוך צינורות אטומים. מזהמים נצמדים בחוזקה למשטחים הפנימיים. בינתיים, סביבות סגורות לחות מולידות חיידקים, טחב ואצות. הם משתלבים עם פסולת ויוצרים בוצה ביולוגית שקשה להסירה ומפיצה ריחות רקובים ועובשים. עבור צינורות שנותרו במצב סרק לתקופות ממושכות, תסיסת מים עומדים מכפילה את מהירות התקשות הלכלוך.
למרות שצינור ניקוי הניקוז רגיש להתכלות, ניתן למנוע בעיות הקשורות באמצעות תחזוקה שוטפת. לאחר כל יישום, שטפו את הצינור במים נקיים למשך למעלה מ-30 שניות. רוקנו את כל המים העומדים ותלו את הצינור לייבוש מאוורר. שטיפה שבועית בחומץ לבן מדולל או בחומרי ניקוי מקטרות מיוחדים ממיסים אבנית ושומן. בדוק את התנאים הפנימיים במרווחים ונקה שיער כלוא ולכלוך עקוב. ניקוי עקבי נכון מונע עכירות עיקשת, שומר על ניקיון הקיר הפנימי ומבטיח ניקוז חלק.